La Microbiologia clinica è quella branca della Medicina di Laboratorio dedicata allo studio delle malattie infettive da agenti patogeni. Si avvale di tecniche colturali, microscopiche ed immunologiche che possono essere applicate ai più svariati materiali (liquidi, essudati e tessuti) prelevati dall'organismo.
I microrganismi responsabili di una malattia infettiva sono molteplici, per cui la stessa microbiologia può essere divisa in branche in base al tipo di microrganismo cercato. La virologia, ad esempio, si occupa dello studio dei virus; la batteriologia dei batteri; la micologia dei miceti e la parassitologia dei parassiti uni o pluricellulari (protozoi, nematodi e cestodi).
La raccolta e il tempo di raccolta dei campioni rappresentano un passaggio cruciale per il corretto isolamento dei microrganismi responsabili delle varie malattie infettive. Vanno quindi tenute in considerazione alcume norme generali che possano permettere il corretto isolamento dell'agente infettivo.

Di seguito sono elencate le ricerche che vengono effettuate nel nostro Laboratorio.

• Tampone faringeo
• Tampone nasale
• Tampone auricolare
• Tampone congiuntivale
• Tampone orale
• Tampone ferita
• Tampone vaginale (ricerca germi comuni più ricerca specifica Streptococco beta emolitico, Gardnerella, Trichomonas, Gonococco, Ureaplasma, Mycoplasma, MIceti)
• Tampone vulvare
• Tampone uretrale
• Spermiocoltura
• Esame colturale liquidi vari (sinoviale, ascitico ecc.)
• Urinocoltura
• Ricerca Ureaplasma
• Ricerca Micoplasma
• Coprocoltura per Salmonella
• Coprocoltura per Shigella
• Coprocoltura per Yersinia
• Coprocoltura per Coli enteropatogeni
• Coprocoltura per germi comuni
• Esame chimico fisico delle feci
• Esame parassitologico delle feci
• Scotch test
• Adenovirus (Ricerca dell'antigene)
• Rotavirus (Ricerca dell'antigene)
• Campylobacter (Ricerca dell'antigene)
• Antibiogramma
• Antimicogramma
• Esame microscopico diretto